利用加权基因共表达网络分析挖掘促进乳腺癌循环肿瘤细胞转移的关键基因
作者：曾祎凡,张京伟,邵尤城,龚鹏举,陈芳芳 单位：武汉大学中南医院甲状腺乳腺外科；武汉大学基础医学院病理生理学教研室 本文刊于： 《武汉大学学报(医学版)》 2021年第01期
关键词:
乳腺癌 加权基因共表达网络分析 循环肿瘤细胞 转移Keywords
Breast Cancer, Weighted Gene Co-Expression Network Analysis(WGCNA), Circulating Tumor Cell(CTC), Metastasis
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摘要
目的:通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法筛选促进乳腺癌循环肿瘤细胞转移的基因,为乳腺癌转移的早期预警提供循环肿瘤细胞标志物,也为乳腺癌发展动态监测提供新策略。方法:利用WGCNA筛选出数据集GSE9893中与乳腺癌转移相关的基因,将所选基因与在循环肿瘤细胞数据库中高表达的基因取交集作为候选基因,最后在肿瘤基因组计划(TCGA)数据库中验证候选基因的表达水平。结果:1 024个基因在伴转移的乳腺癌中高表达,WGCNA从中得到与乳腺癌转移相关的67个基因,其中ACTB和DDX5基因在乳腺癌循环肿瘤细胞中呈现出高表达的状态,并且DDX5在TCGA伴转移的乳腺癌样本中也高表达。结论:DDX5可作为乳腺癌发展动态监测的循环肿瘤细胞标志物,并可能为乳腺癌治疗提供新的靶点。
本文地址：www.fabiao.net/content-22-9332-1.html
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