基于计算机虚拟技术研究花椒毒素及其同分异构体对细胞色素P450的抑制作用差异

本文刊于: 《药物评价研究》 2021年第0期

关键词:
花椒毒素 香柑内酯 异佛手柑内酯 同分异构体 细胞色素P450 计算机虚拟技术

Keywords:
methoxsalen,bergapten,isobergapten,isomers,CYP450 enzymes,computer virtual technology,"Cocktail" drug probe method
摘要
     目的研究花椒毒素及其同分异构体对药物代谢酶细胞色素P450(CYPs)的抑制差异。方法采用计算机虚拟技术研究花椒毒素及其同分异构体香柑内酯、异佛手柑内酯与6种CYPs酶(CYP1A2、CYP2D6、CYP3A4、CYP2C19、CYP2C9、CYP2A6)的相互作用;采用Amber(ff99SB)软件进行花椒毒素、香柑内酯、异佛手柑内酯与CYP2A6的动力学模拟研究;采用"Cocktail"药物探针法进行验证,分别测定这3种同分异构体对人肝微粒CYPs酶活性的影响,以及对CYP2A6与CYP1A2的半数抑制浓度(IC50)。结果计算机模拟技术结果显示,花椒毒素、香柑内酯、异佛手柑内酯对6种CYPs结合能力不同,对CYP2A6的结合能力差异明显。分子对接、分子动力学结果表明,花椒毒素与CYP2A6形成的氢键ASN297∶HD22-M∶O4是花椒毒素与CYP2A6结合过程中最重要的且稳定的氢键,香柑内酯与ASN297产生的分子间氢键稳定性低于花椒毒素体系,异佛手柑内酯在动力学中所产生的氢键均不稳定;受体活性口袋中疏水性氨基酸与口袋形状互补是促成配体受体结合的重要因素。"Cocktail"药物探针法表明,花椒毒素、香柑内酯、异佛手柑内酯对CYPs均具有不同程度的抑制作用,其中对CYP1A2具有显著抑制作用,相对剩余酶活力分别为2.67%、4.64%、13.58%,其IC50分别为1.42、2.29、5.12μmol/L;对CYP2A6的抑制作用存在差异,相对剩余酶活力分别为8.10%、38.91%、74.98%,其IC50值分别为3.89、44.03、103.30μmol/L。结论花椒毒素、香柑内酯、异佛手柑内酯对CYP1A2具有明显的抑制作用,对CYP2A6的抑制效果存在明显差异。甲氧基的取代位置与呋喃环骈合的位置对3种化合物与CYP2A6结合影响较大,其中CYP2A6活性口袋中ASN297是蛋白受体与配体结合的关键氨基酸残基。

基金项目:
教育部创新团队发展计划资助项目(IRT_14R41);广东省自然科学基金资助项目(2020A1515010156);广东省普通高校重点领域专项(2019KZDZX1006)

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