甘蓝型油菜C2连锁群种子含油量QTL簇及品质性状的分析

Analyzing the QTL Cluster of Seed Oil Content and Quality Traits on C2 Linkage Group in Brassica Napus L.

作者: 专业:发育生物学 导师:孟金陵 年度:2010 学位:硕士  院校: 北方工业大学

Keywords

        油菜是我国主要油料作物之一,优质菜油饱和脂肪酸含量低,是食用植物油之佳品;由于菜籽油中脂肪酸的碳链长度与柴油相近,也是生产生物柴油的理想原料。因此,提高油菜含油量一直是众多科学家与育种家关注的目标。本实验室以甘蓝型油菜欧洲冬性品种Tapidor和中国半冬性栽培种Ningyou7为亲本构建了TN DH作图群体和遗传图谱,利用该图谱定位了种子含油量QTL,并在C2连锁群上发现了一个含油量QTL簇(命名为qcOCC2)。通过回交、表型筛选和分子标记辅助选择,构建了导入供体亲本Tapidor的qcOCC2片段的高世代回交群体和近等基因系。为了解析qcOCC2的遗传效应及克隆相关基因,必须在C2连锁群尤其是目标区间qcOCC2内加密足够的分子标记。本研究共采用了两种方法加密分子标记:1. Federico等基于甘蓝序列信息一共开发了587对SSR引物。经本实验前期的研究,目标区间qcOCC2与拟南芥第1染色体的E区段(C1E)、第5染色体的A区段(C5A)及E区段(C5E)同源,基于此,我们挑选出63个标记用于本研究;另外,从浙江农科院赵坚义博士获得5个定位于SG DH群体的C2连锁群的ATH及ZAAS标记用于本研究。最终,共8个标记定位于TN DH群体的C2连锁群,其中7个ATH及ZAAS标记定位于目标区间内。2.在实验室已构建Tapidor BAC文库的基础上,对Tapidor BAC末端进行了测序。将BAC末端序列与拟南芥基因组进行比对,挑选与拟南芥C1E、C5A或C5E高度同源(80%)的BAC作为候选BAC。然后将候选BAC的BAC-end序列与白菜A2染色体的BAC序列进行BLAST比对,从中挑选与A2 BAC同源性在80%-95%的Tapidor BAC-end序列进行引物设计,将其命名为BES引物。共设计出41对BES引物用于本研究,最终有6个标记定位于目标区间qcOCC2。随后,我们用定位在TN遗传图谱C2连锁群上的68个分子标记检测142份甘蓝型油菜的品种材料。用关联分析的方法来检测在自然群体中含油量表型及其它品质性状与这些标记之间的关系,并将关联分析的结果与QTL分析的结果进行比较分析,发现两者结果基本吻合。在关联分析中检测到的与含油量以及其它品质性状显著相关联的分子标记,大多数都位于家系连锁定位(FBL)的QTL置信区间内。因此可以得出如下结论:1.含油量表型与C2连锁群上标记之间确实存在一定的关联性;2.在TN群体以及该自然群体中,有相同的位点与含油量表型相关,这也验证了本研究中含油量QTL的真实性。
    
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