基于宏基因组学技术分析“泡菜老汤”发酵甘蓝原核微生物群落结构

2018年第02期

关键词:
泡菜老汤;甘蓝;变性梯度凝胶电泳技术;微生物群落结构

Keywords
pickle aged brine;cabbage;PCR-DGGE;microbial community structure
摘要
     为了改进发酵蔬菜的工艺,研究"泡菜老汤"对发酵甘蓝原核微生物群落结构的影响。通过聚合酶链式反应结合变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术,分离发酵甘蓝体系混合微生物16S r DNA V3区基因片段,采用Quantity One软件分析原核微生物香农指数(Shannon-Wiener index)多样性指数、主成分分析及相似性聚类分析。结果表明,新汤中微生物数量多于老汤;新汤中Shannon-Wiener指数随发酵时间的变化规律为低-高-较低,老汤中香农指数随发酵时间的变化规律为高-低-较高;主成分分析说明甘蓝老汤1~8 d聚合在一起;新汤中除了第1 d,其他的也都聚合在一起;聚类图谱显示新汤第8 d与老汤1~8 d的所有样品微生物群落高度相似,表明老汤的原核微生物群落结构较新汤更稳定,建议发酵蔬菜的工艺采用"泡菜老汤"发酵。


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