基于网络药理学及生物信息学探讨防风治疗骨关节炎的物质基础及作用靶点研究
作者:钱浩,王逸宁,储非凡,叶蓁,詹蕙璐,郑绿珍 单位:温州医科大学第一临床医学院(信息与工程学院),温州医科大学口腔医学院,温州医科大学仁济学院 本文刊于: 《中国药师》 2021年第0期
关键词:
网络药理学 防风 骨关节炎 生物信息学 PI3K-AKT信号通路Keywords:
Network pharmacology,Saposhnikoviae Radix,Osteoarthritis,Bioinformatic,PI3K-AKT signaling pathway
摘要
目的:运用网络药理学及生物信息学方法探讨防风治疗骨关节炎的物质基础及作用靶点。方法:通过相关数据库获得了防风的活性成分、预测靶点以及骨关节炎相关基因,并对有效成分-疾病交集靶点进行了蛋白互作、网络构建和富集分析;同时从基因表达综合数据库(GEO)中获得人骨关节炎的差异基因,进行通路富集,以验证防风作用于骨关节炎的可能通路。最终将可能有效成分与潜在靶点进行分子对接验证。结果:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),筛选获得了防风中18种有效成分,共对应82个靶点。通过Gene Cards数据库筛选,获得了2 496个骨关节炎相关基因,最终得到52个有效成分-疾病交集靶点。GEO数据集分析后得到688个骨关节炎的差异基因。最终预测防风中的汉黄芩素可能通过蛋白激酶Bα(AKT1)作用于磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-AKT)通路以调节骨关节炎。结论:本研究探讨了防风治疗骨关节炎可能的活性成分及靶点,为研究防风治疗骨关节炎机制提供了理论基础。
基金项目:
国家级大学生创新创业训练计划项目(编号:201910343018);浙江省新苗人才计划项目(编号:2020R413031、2020R413064)
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