肩袖损伤后脂肪浸润基因表达谱及关键通路的生物信息学分析
作者:刘沛东,冯江峰,徐文杰,许晓栋,杨自权 单位:山西医科大学第二医院运动医学科,山西医科大学第二医院骨与软组织损伤修复省重点实验室 本文刊于: 《中国组织工程研究》 2021年第0期
关键词:
肩袖损伤 脂肪浸润 差异基因 生信信息学 GEO数据库Keywords:
rotator cuff tear,fatty infiltration,differential genes,bioinformatics,GEO database
摘要
背景:脂肪浸润是肩袖修补术后失败的关键因素,然而肩袖损伤后脂肪浸润的病理变化机制尚不清楚。目的:旨在探索肩袖损伤后关键基因的表达差异,确定其功能和机制通路,为肩袖损伤脂肪浸润的病理变化机制提供理论依据。方法:通过GEO数据库获取GSE93661芯片筛选差异表达基因,采用GO、KEGG分析脂肪浸润的潜在机制。通过构建PPI网络获取枢纽基因,分析潜在致病靶点。结果与结论:共鉴定差异表达基因471个。GO和KEGG分析表明神经活性配体-受体相互作用、细胞黏附分子通路是肩袖损伤脂肪浸润的潜在机制。白三烯B4受体(LTB4R)作为PPI网络中的枢纽基因,可能是肩袖损伤脂肪浸润的关键靶标。提示:文章发现了肩袖损伤后脂肪浸润病理发展中潜在的关键基因和通路,为今后的治疗提供了参考方向。